Los siglos de historia de esta región se manifiestan no solamente en los monumentos y ciudades históricas, así como en sus zonas arqueológicas, sino en la cultura viva de la cotidianidad colorida de sus habitantes por sus festividades,
creencias religiosas, arte, música, y baile, prácticas agrícolas, artesanías, y su cocina tradicional.
El patrimonio cultural de esta región aunado a sus riquezas naturales han sido reconocidos a nivel nacional e internacional. A continuación se encuentran algunas de las designaciones a nivel internacional:
Ciudad prehispánica y parque nacional de Palenque; Chiapas
Ciudad histórica fortificada de Campeche; Campeche
Ciudad prehispánica de Uxmal; Yucatán
Ciudad prehispánica de Chichén-ltzá; Yucatán
Antigua Ciudad Maya y bosques tropicales protegidos de Calakmul, Campeche
Sian Ka’an, Quintana Roo (también Reserva de la Biosfera)
Bosques tropicales protegidos de Calakmul, Campeche
Sian Ka’an, Quintana Roo
Río Celestún, Yucatán
Reserva de la Biosfera Banco Chinchorro, Quintana Roo
Isla de Cozumel, Quintana Roo
Reserva de la Biosfera
Banco Chinchorro,
Quintana Roo
El Arco del Tiempo
del Río La Venta,
Chiapas
Ciudad Histórica
de Izamal, Yucatán
Los Petenes – Río
Celestún, Yucatán
Cenotes del Cráter
Chicxulub, Yucatán
Región Lacan-Tún /
Usumacinta
Además de la construcción de las 19 estaciones y 13 paraderos nuevos, el proyecto Tren Maya contempla la rehabilitación de las estaciones de la antigua vía férrea del Ferrocarril del Istmo de Tehuantepec (FIT).
De estas 38 estaciones, pocas continúan en uso, por lo que FONATUR Tren Maya ha iniciado el proyecto de replantear los espacios en desuso para convertirlos en Centros Integradores de Bienestar junto con la Secretaria de Bienestar para convertir estos espacios en lugares con servicios esenciales, además de ser puntos de convivencia para las comunidades.
En los casos de las numerosas estaciones que están catalogadas como inmuebles históricos por el INAH o el INBAL (en algunos casos con ambos), FONATUR trabajará
con dichas dependencias para su adecuada restauración, manteniendo rasgos originales y contribuyendo a al patrimonio ferroviario inmenso de las regiones en donde se encuentran en los estados de Chiapas, Campeche, y Yucatán).